限制性酶切分析
合成基因的设计
Blast 简易分析
(新)
Blast 高级分析
(新)
绘制系统进化树
氨 基 酸 表
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) 平台
DNA、蛋 白 质 序 列 的 同 源 性 分 析 比 较
请
选择
: 程序名称
blastn
blastp
blastx
tblastn
tblastx
和 数据库名称
杆状病毒 DNA
杆状病毒 蛋白质
常用克隆载体 DNA
大肠杆菌 DNA
大肠杆菌蛋白质
艾滋病病毒 DNA
艾滋病病毒蛋白质
土壤根癌农杆菌 DNA
土壤根癌农杆菌蛋白质
苏云金杆菌 DNA
苏云金杆菌蛋白质
虹彩病毒 DNA
虹彩病毒蛋白质
日本血吸虫 DNA
日本血吸虫蛋白质
并请在下列表单中
键(贴)入
FASTA
格式的 DNA
碱基
或 蛋白质
氨基酸
序列
> Dr. F's lab unknown species DNA fragment tcgatacgac tgacgactgc tcgcgattac tgcagcgaga tcgcggagaa tcgcgagagt tccagaatga aaagaagatc cctgttccag aatcatacaa tcgcagagga aaatgttaat cgcaatatcc aaaaatttga agatgtacat gtagtgggag tatatagata tcaattttca agagaacaga taggtttaag tgtattaggt aaaaatgatg tccaaaagaa gaagaaggaa tcgactagag cttggtgcag cgcgtgtgac gtgccttgct atgtttgtg
或 直接从
软(硬)盘
中读取
BLAST 程序的详细说明
●
将缺省值设定为“
自动将输入数据...转换
”,使所得的比较结果更具有
生物学意义
自动
将输入数据中包含的统计学上显著但
无生物学意义
的序列
转换
(如将相应碱基序列转换成"NNNNNNNN"或相应氨基酸换成"XXXXXXXX",以突出其实际意义)
统计
阈限E值
0.0001
0.01
1
10
100
1000
算法
矩阵
PAM30
PAM70
BLOSUM80
BLOSUM62
BLOSUM45
无间隔
对比分析
选用的
遗传密码
(仅限于 Blastx 程序)
Standard (1)
Vertebrate Mitochondrial (2)
Yeast Mitochondrial (3)
Mold Mitochondrial; ... (4)
Invertebrate Mitochondrial (5)
Ciliate Nuclear; ... (6)
Echinoderm Mitochondrial (9)
Euplotid Nuclear (10)
Bacterial (11)
Alternative Yeast Nuclear (12)
Ascidian Mitochondrial (13)
Flatworm Mitochondrial (14)
Blepharisma Macronuclear (15)
读码框移位
限度(仅用于 Blastx 程序)
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
25
30
50
1000
No OOF
图形
效果显示 高级
参数
选项
总体列表
行数极限
0
10
50
100
250
500
显示
同源系列详细对比结果
的清单个数极限
0
10
50
100
250
500
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