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BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) 平台
同源性分析 是分子生物学与生物信息学研究的重要内容。为此,本网站特建立了 基因岛 DNA、蛋白质同源性分析比较 平台。平台是以目前最为流行(也是运算最快)的 BLAST 算法(Altschul et al., 1997, Nucleic Acids Res. 25:3389-3402)为基础,借鉴 NCBI 源码发展而成的。同源性分析的目标数据库则是 基因岛机器人(GeneDataMax)软件 自动建立与动态维护的数据库。 作同源分析时,请您先选择好 DNA 或 蛋白质,而后选择 目标数据库,之后再将 DNA 碱基 或 蛋白质 氨基酸 序列按 FASTA 格式 键(贴)入 下列表单(也可经“浏览”键读取),最后按“开始检索分析”键即可。FASTA 格式第一行是文字说明,以 > 字符开头,例如:“> Dr. X's lab unknown virus DNA fragment”;第二行开始才是数据(第一行与第二行之间一定要用“硬回车”,即 Return 键隔开)。 为便于您更好地掌握 同源分析平台 的使用方法,我们亦预先键入了某实验室未知病毒DNA部分片段的数据作为样本,并选择“杆状病毒DNA”作为目标数据库;您只要用鼠标在“开始检索分析”按钮上点一下,即可获取未知病毒DNA部分片段与 已知所有的 杆状病毒 DNA 同源比较分析的结果。若您要输入自己的数据,则请先按“清空表单”键 ... | ||||||||||||